系统进化树简介及构建

系统进化树简介及构建

系统进化树学习笔记。

系统进化树简介

系统进化树（

Phylogenetic tree

）

：⽤⼀种类似树状分⽀图形来概括各节点之间的进化关系，节点可以是不同物种、同⼀物种不同样本、不同基因

等。可体现物种进化关系和演化历程，群体内部样本亲缘关系，基因家族成员分类和进化关系等。

分类：根据是否指定跟节点，可分为有根树和⽆根树。

⽆根树：没有指定祖先节点，进化树只呈现各个节点的拓扑结构和相关距离。

⽆根树

有根树：指定根节点，进化树可呈现各个节点的距离和祖先节点以及各个分枝分化的先后关系，可⽤于分化时间的推断。